RNAflash™ DCA 1-step RT qPCR (SYBR Green)kit
免提RNA,高通量qPCR检测神器
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- 产品描述
- 组成成分
- 注意事项
-
货号:500-103
1. 产品保存:
- 15℃至-25℃保存一年,干冰运输。
2. 产品简介:
RNAflash DCA(Direct Cellular Amplification)one step RT qPCR (SYBR Green)kit 是一款快速、高效地从“细胞”直接到“扩增结果” 的 全套试剂盒,适用于 10 - 10^5 个培养细胞的基因表达分析。本产品无需传统提取繁琐的流程,可在细胞培养板中直接完成基因组 DNA 清除和RNA 获取;搭配高效率、高稳定性、高特异性的一步法染料法 RT- qPCR 试剂,快至 52 min 即可从细胞中得到基因表达结果。本试剂盒操作便捷,可兼容广泛的细胞类型(贴壁和悬浮细胞)及细胞量,在提高效率的同时减少纯化过程中的样品损失,也可解决传统提取方式中低细胞数提取效果不佳的问题。本试剂盒可用于高通量(96/384 孔板)细胞 RNA 的表达分析。
3. 产品特点:
普适性:多种细胞类型的基因表达分析,从 10 个到 10⁵个常规培养细胞或稀有细胞,均可实现有效检测;
免纯化工艺:简化传统 RNA 提取流程,在培养孔内 5 分钟完成细胞裂解,7 分钟内完成 gDNA 消化,避免纯化造成的 RNA 损失;
高通量兼容:满足大规模细胞样本的平行处理需求,显著降低了高通量检测过程中的时间成本以及操作误差;
高效率:优化的一步法 RT qPCR 体系兼容裂解体系,最快检测仅需 52min。
4. 产品组成:(50T裂解+100T qPCR)
货号 组分 规格(50T+100T/20 μL) 说明 储存条件 500-103-1 Lyse™ Buffer (a) 2500µL/支 裂解缓冲液 融解置于2-8℃ 500-103-2 Purge™ Enzyme 100µL/支 基因组去除酶 -20℃ 500-103-3 StopXtract™ Buffer (b) 250µL/支 终止缓冲液 分装置于-20℃ 500-103-4 DCA One-Step RT-qPCR Enzyme Mix 100µL/支 酶混合液 -20℃ 500-103-5 DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix(c) 1000µL/支 缓冲液混合液 -20℃ a. Lyse™ Buffer解冻后可于2 ~ 8℃条件下稳定存放1年。
b. StopXtract™ Buffer应避免反复冻融 ,需分装后置于-20℃。
c. DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix含dNTP Mix , Mg2+ ,热启动Taq酶、逆转录酶和荧光染料等 ,该组分在拆包装后需避光保存。
5. 自备材料和试剂ROX 校正染料 , 1 × PBS 缓冲液 、RNase-free ddH2O 、RNase-free 吸头 、 1.5 ml RNase-free 离心管 、0.2 ml RNase-free 八联排/PCR 管等。
6. 实验工作流程图

7. 实验流程
7.1 RNA获取
7.1.1 样本处理与准备
l 贴壁细胞:
(a) 洗涤细胞:将不同孔板的贴壁细胞轻轻去除细胞培养基后,贴壁缓慢加入对应量的胰酶,37℃培养箱消化3-5 min ,并在显微镜下观察细胞形态。当细胞开始变圆、细胞间隙变大时,说明消化接近完成,随后加入适量的含血清培养基终止消化作用,轻轻吹打细胞,使细胞脱落并形成单细胞悬液,1000 rpm (930 × g) , 4℃离心5 min ,移除培养基后,等体积的预冷的1×PBS洗涤,1000rpm (930 × g) , 4℃离心5 min收集至管底,加入适量PBS(细胞数量测试的线性范围为10至10^5个) , 置于冰上备用。
注意1:去除培养基或PBS时动作应尽量轻缓 ,避免在清洗过程中造成细胞损失。
注意2:若贴壁细胞为96孔或者384孔板培养 ,则去除培养基后直接用预冷PBS洗涤即可;若铁壁细胞使用其他容器培养 ,则需用胰蛋白酶将贴壁细胞从容器壁解离下来 ,并对胰蛋白酶失活处理 ,可加入适量的含血清的完全培养基中和胰蛋白酶 ,离心去除培养基后 ,预冷PBS连续洗涤细胞2-3次。
(b) 稀释细胞:根据实验需求(细胞数量测试的线性范围为10至10^5个) ,用预冷的1 × PBS稀释细胞,将稀释后的细胞悬液分装至200 μL PCR管中,每管5 μl (保持细胞数在10 - 10^5个/管) ,置于冰上备用。
l 悬浮细胞:
(a) 去除培养基:将悬浮细胞转移至离心管中,1000 rpm (930 × g) , 4℃离心5 min收集至管底, 去除培养基。
(b) 洗涤细胞:加入预冷的1 × PBS (尽量保证细胞密度处于2 ×10^4至2 ×10^6个/mL, 500 μl/105个细胞),用移液器轻轻吸打8 - 10次,无明显细胞团即可;1000 rpm (930 × g) ,4℃离心5 min收集至管底,去除PBS。
(c) 稀释细胞:根据实验需求(细胞数量测试的线性范围为10至10^5个) ,用预冷的1 × PBS稀释细胞,将稀释后的细胞悬液分装至200 μL PCR管中,每管5 μl (保持细胞数在10 - 10^5个/管) ,置于冰上备用。
注意 :去除培养基或PBS时动作应尽量轻缓 ,避免在清洗过程中造成细胞损失。
7.1.2 RNA获取
(a) 配制裂解工作液(200 μL PCR管)
组份 体积 (μL) Lyse™ Buffer 48 Purge™ Enzyme 2 注意 :裂解工作液按照孔板所需体积进行配制 ,各组分的比例为Lyse™ Buffer : DNase I : Purge™ Enzyme = 24 : 1。 配制完毕 ,颠倒混匀10 - 15次 ,避免剧烈涡旋振荡;混匀后置于冰上 ,请在1 h内使用。
(b) 向含有细胞的96孔板中加入50 μL裂解工作液,移液器轻轻吸打8 - 10次充分混匀,室温静置5 min裂解细胞。
(c) 加入5 μL StopXtract™ Buffer ,移液器轻轻吸打8 - 10次混匀,室温静置2 min终止反应。注意 : 裂解产物可置于冰上保存2h ,若需长期保存需置于-80℃。
7.2 一步法RT qPCR反应
7.2.1 配置反应体系
按下表 1 在冰上配制反应体系
表 1 一步法 RT-qPCR (染料法)试剂盒反应体系
试剂 单个反应体积(μL)(1 ) DCA One-Step RT-qPCR Enzyme Mix 1 DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix 10 10 µM 靶标上游引物(2,3,4) 0.4 10 µM 靶标下游引物 0.4 细胞裂解液 X(参考步骤 7.2.2) ROX 校正染料(5) Y RNase-Free/DNase-Free 水 Up to 20 μL 注意 :1. 将各组分置于冰上融解 ,轻微混匀离心后 ,加液顺序按照体系从多到少。
2. 一般来说反应体系中引物终浓度为 0.2 μM 即可得到较好的扩增效果。 当反应性能比较差时 ,可以在 0.1 - 1.0 μM 范围内调整引物浓度。
3. 可根据检测需要 ,增加靶标个数
4. 扩增产物长度请选择在 100 - 500 bp 范围内 ,尤其推荐 100 - 200 bp 之内。
5. 若使用需要校正染料的 qPCR 仪 ,则按照注意事项中建议的浓度投入到体系。
7.2.2 模板投入
向实验组的 PCR 反应管中分别加入 2-8 μL 细胞裂解液,使用 5 μL RNase-Free/ Nuclease Free H2O 作为无模板对照 (NTC 组),每组设置 3 个重复。
注意 :投入 2-8μL 细胞裂解液 ,对扩增无抑制作用 ,细胞裂解液投入体积尽量不要低于 1 μL ,避免吸液不准造成的误差。
7.2.3 反应程序
将反应体系轻轻混匀,并短暂离心,随后运行表 2 程序。
表 2 一步法 RT-qPCR (染料法)试剂盒反应程序
步骤 循环数 反应温度 反应时间 收集信号 逆转录(5) 1 cycle 50℃ 3 min 否 预变性 1 cycle 95℃ 30 sec 否 变性 40 cycle
95℃ 10 sec 否 延伸 60℃ 30 sec 是 熔解(6) 根据仪器型号选择 注意 :5. 对于具有复杂二级结构或高 GC 区域的模板 ,将逆转录温度提高到 55℃ , 有助于提高扩增效率和灵敏度。逆转录时间可延长至 15 min,有助于提高 cDNA 产量。
6.一般在延伸步骤后 ,需要添加熔解步骤来检验扩增特异性 ,请根据仪器型号进行选择。
7.2.4 No RT Control 反应(可选)
No RT Control 是指不加逆转录酶的逆转录阴性对照反应,用于检验 RNA 模板中是否有基因组 DNA残留。也可使用 Fast Taq SYBR Green qPCR Mix(货号 500- 102)进行检测。
注意事项:
1.按照注明的储存条件和要求对试剂储存,比如为避免StopXtract™ Buffer反复冻融,应对其分装后置于-20℃。
2. 裂解细胞时,吹打时尽量轻柔,避免剧烈起泡。
3. 一步法RT-qPCR(染料法)酶反应液含有高浓度的甘油,使用前请短暂离心,收集到反应管底部,并用移液枪
轻轻吸打,充分混匀后准 确吸取。
4. 反应液的配制请使用RNase-free枪头,EP管等,尽量避免污染。
5. 本制品中未配有ROX Reference Dye ,如果反应中需要添加ROX Reference Dye用以校正孔间荧光信号值误差,
请根据仪器设备说明书要求确定是否添加ROX Reference Dye(一般需要高浓度ROX校正的仪器的ROX工作浓度为0.4 μM;需要低浓度ROX校正的工作浓度为0.08 μM ,仪器见表3),ROX Reference Dye 产品在反应体系中建议50X稀释使用(例如,50μl反应体系中添加1μl ROX Reference Dye),如果实验结果不理想,可调整ROX Reference Dye添加量。
仪器 无需添加ROX
(Bio-Rad) IQ5, CFX96, CFX384, CFX Connect, MJOpticon, Opticon 2;
(Cepheid) SmartCycler®System, Smart Cycler II System;
(Roche) LightCycler®2.0, 480, 96;
(Qiagen) Rotor-Gene Q, 3000, 6000;
(Bioer) Line-Gene;
(Eppendorf) Mastercycler ep realplex;
(Analytik Jena) qTOWER3;
添加ROX
(终浓度为0.4μM)
(Thermo) ABI7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900HT Fast, StepOne, StepOnePlus
添加ROX
(终浓度为0.08μM)
(Thermo) ABI 7500, 7500 Fast, ViiA7, QuantStudio 3 / 5, QuantStudio 6 / 7 / 12K Flex,
QuantStudioTMDx;
(Agilent) Mx3000P, Mx3005P, MX4000;
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产品组成:(50T裂解+100T qPCR)
货号 组分 规格(50T+100T/20 μL) 说明 储存条件 500-103-1 Lyse™ Buffer (a) 2500µL/支 裂解缓冲液 融解置于2-8℃ 500-103-2 Purge™ Enzyme 100µL/支 基因组去除酶 -20℃ 500-103-3 StopXtract™ Buffer (b) 250µL/支 终止缓冲液 分装置于-20℃ 500-103-4 DCA One-Step RT-qPCR Enzyme Mix 100µL/支 酶混合液 -20℃ 500-103-5 DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix(c) 1000µL/支 缓冲液混合液 -20℃ a. Lyse™ Buffer解冻后可于2 ~ 8℃条件下稳定存放1年。
b. StopXtract™ Buffer应避免反复冻融 ,需分装后置于-20℃。
c. DCA One-Step RT-qPCR Buffer Mix含dNTP Mix , Mg2+ ,热启动Taq酶、逆转录酶和荧光染料等 ,该组分在拆包装后需避光保存。
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注意事项:
1.按照注明的储存条件和要求对试剂储存,比如为避免StopXtract™ Buffer反复冻融,应对其分装后置于-20℃。
2. 裂解细胞时,吹打时尽量轻柔,避免剧烈起泡。
3. 一步法RT-qPCR(染料法)酶反应液含有高浓度的甘油,使用前请短暂离心,收集到反应管底部,并用移液枪
轻轻吸打,充分混匀后准 确吸取。
4. 反应液的配制请使用RNase-free枪头,EP管等,尽量避免污染。
5. 本制品中未配有ROX Reference Dye ,如果反应中需要添加ROX Reference Dye用以校正孔间荧光信号值误差,
请根据仪器设备说明书要求确定是否添加ROX Reference Dye(一般需要高浓度ROX校正的仪器的ROX工作浓度为0.4 μM;需要低浓度ROX校正的工作浓度为0.08 μM ,仪器见表3),ROX Reference Dye 产品在反应体系中建议50X稀释使用(例如,50μl反应体系中添加1μl ROX Reference Dye),如果实验结果不理想,可调整ROX Reference Dye添加量。
仪器 无需添加ROX
(Bio-Rad) IQ5, CFX96, CFX384, CFX Connect, MJOpticon, Opticon 2;
(Cepheid) SmartCycler®System, Smart Cycler II System;
(Roche) LightCycler®2.0, 480, 96;
(Qiagen) Rotor-Gene Q, 3000, 6000;
(Bioer) Line-Gene;
(Eppendorf) Mastercycler ep realplex;
(Analytik Jena) qTOWER3;
添加ROX
(终浓度为0.4μM)
(Thermo) ABI7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900HT Fast, StepOne, StepOnePlus
添加ROX
(终浓度为0.08μM)
(Thermo) ABI 7500, 7500 Fast, ViiA7, QuantStudio 3 / 5, QuantStudio 6 / 7 / 12K Flex,
QuantStudioTMDx;
(Agilent) Mx3000P, Mx3005P, MX4000;
关键词
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